環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品，嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章，受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止，云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗，樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病，客戶發表文章達20篇以上，“云序制造”越來越多的出現在科研論文當中。
表1.云序客戶環狀RNA文章列表
自2013年的兩篇在Nature期刊上對于環狀機制研究成果問世以來，對于環狀RNA的關注達到了空前的地步，迅速成為RNA領域最火熱的明星分子之一。環狀RNA相比于線性結構的mRNA分子，具有更穩定的環狀封閉結構，因此在循環體系中環狀的表達量更穩定。多篇文章已報道環狀RNA可行使“microRNA海綿機制”，通過競爭性的結合miRNA間接影響mRNA，在多種疾病的發生發展中起到了重要的調控作用。環狀RNA的研究從傳統的“海綿機制”逐步發展多元化，更多的呈現出功能的多樣性，如結合功能蛋白、編碼蛋白潛能、影響可變剪切、受甲基化調控等。無處不在的功能覆蓋讓環狀研究備受親睞。新年伊始，云序生物公眾號將為大家優中評優，悉數云序客戶部分的環狀RNA研究成果.
一、云序生物醫口環狀RNA文章
1.世界首篇紅斑狼瘡性腎炎環狀RNA研究（影響因子：6.4）
環狀RNA作為一種新發現的非編碼RNA，在多種組織及疾病中發揮重要的生物學功能，然而關于其在紅斑狼瘡性腎炎中的研究鮮有報道。紅斑狼瘡性腎炎作為一種免疫缺陷性疾病，嚴重影響了患者的身體健康和生活質量。云序攜手中國醫科大學周華主任團隊在Cell子刊“Molecular
Therapy Nucleic Acids”上發表重要研究成果，首次通過全轉錄組測序構建了該疾病的環狀RNA表達譜，并從313條差異表達結果中挑選感興趣的環狀RNA--CircHLA-C。前期，作者發現miR-150在該疾病中發揮著重要的調控作用，通過生信預測結果顯示該環狀能夠通過競爭性吸附miR-150。
2. 世界首篇小鼠腸道電離輻射環狀RNA變化研究（影響因子：5.5）
中國醫學科學院放射醫學研究所劉強團隊利用云序生物提供的全轉錄組測序服務成功揭示了circRNAs在小鼠空腸輻射后表達的變化，為研究circRNAs在輻射致腸損傷中的作用提供了靶分子。高質量的測序技術對每一個環狀的表達都做到精準檢測，生信分析可視化從宏觀角度（染色體分布、成環位置）給出了所有對于放射處理后在小鼠空腸組織當中環狀RNA分子的表達情況。篩選差異表達的環狀RNA進行環狀RNA定量PCR驗證，GO分析揭示包括結合、催化、細胞因子和細胞分泌等GO條目均發生富集。KEGG分析預測結果顯示差異環狀RNA的靶基因與MAPK信號通路相關，理論與預測完全相符。海綿機制預測ceRNA網絡圖，按照海綿機制的反式調控方式，該網絡中包括42個上調和48個下調的環狀RNA分子，以及預測相互結合的22個靶基因mRNA。
3.世界首篇小鼠腦創傷模型外泌體RNA研究（影響因子：5.2）
本研究作者真正集合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點，利用云序生物提供的全轉錄組測序服務揭示大腦創傷外泌體中環狀RNA的變化及其潛在的生物學功能。研究人員首先分離小鼠腦組織提取腦周質外泌體，通過外泌體全轉錄組測序檢測TBI腦周組織外泌體中環狀RNA的表達變化。結果發現231個差異表達的環狀RNA，其中155個上調，76個下調。接下來通過生信分析如GO及KEGG分析對外泌體差異表達的環狀RNA進行了功能預測。GO分析表明這些RNA分子主要參與神經損傷修復、神經系統發育和神經信號傳導等功能條目，這些分子同時主要富集在Cgmp-PKG信號通路。CircRNA-miRNA互作網絡圖揭示了作用的靶miRNA及可能的功能。本研究首次揭示了大腦創傷外泌體中環狀RNA變化，為后續分子機理詳細研究提供諸多靶分子，也為大腦創傷的干預治療提供潛在的靶點。
圖3：GO Pathway分析顯示環狀來源基因富集到Cgmp-PKG通路和神經投射等功能
4.世界首篇胰腺癌吉西他濱耐藥機制中環狀RNA研究（影響因子：3.8）
吉西他濱是一種晚期胰腺癌重要治療藥物，在疾病治療過程中起重要作用。本篇文章作者首先獲得吉西他濱的耐藥細胞株，通過全轉錄組測序手段對比耐藥細胞株和正常細胞株中環狀RNA的表達譜。作者選取差異表達前10的環狀RNA進行環狀RNA定量PCR驗證測序結果，準確性高達100%，說明測序結果真實可靠。
