“核酸核磁共振”是利用核磁共振光譜學獲得關于多核酸如DNA或RNA的結構和動力學的信息。截至2003年，所有已知RNA結構中近一半已通過核磁共振波譜法確定。
核酸和蛋白質核磁共振波譜相似但存在差異。核酸具有較小的氫原子百分比，這是在NMR光譜學中通常觀察到的原子，并且因為核酸雙股螺旋是剛性的且大致線性的，所以它們不會自行折疊以產生“長程”相關性。通常用核酸完成的NMR的類型是H或質子NMR，13C NMR，15N NMR和31P NMR。 幾乎總是使用二維核磁共振波譜方法，例如相關光譜學（COSY）和總相干轉移光譜學（TOCSY）來檢測穿透式核耦合，核歐佛豪瑟效應(Nuclear Overhauser effect)光譜法（NOESY）來檢測彼此在空間上靠近的核之間的耦合。