應用分預防、治療和診斷三個方面。
1、治療制品
包括各種血液制劑、免疫制劑如干擾素。按治療作用機理可分為特異的（如抗毒素和γ-球蛋白）和非特異的（如干擾素和人白蛋白等）。臨床醫生將抗毒素及γ-球蛋白作常規治療用藥品，實際上也起預防作用。血液制劑在治療用生物制品中占非常大的比例。中國生產和正在研制的血液制劑已有50余種。有些單克隆抗體已用于治療。血液中某些含量少的組分整合到微生物基因中，可大量生產，如□因子。主要的預防和治療用生物制品見表主要的預防和治療用生物制品
2、預防疫苗
包括類毒素的發明是為了預防傳染病。大多數烈性傳染病已有疫苗，根據各種傳染病的性質特點、傳染源、傳播方式，用于預防的疫苗有以下幾種：
①消滅傳染病的疫苗。有些人類傳染病病原體沒有中間寄主，有可能用疫苗高度免疫人群，使病原體不能在人群中傳播并最終被消滅，如天花已被消滅。麻疹、脊髓灰質炎用疫苗高度免疫后，有可能被徹底消滅。
②保護群體的疫苗。如中國的乙型腦炎疫苗、乙型肝炎疫苗、流感桿菌多糖疫苗、流腦多糖疫苗、卡介苗等。例如，以昆蟲為中間寄主的傳染病，往往難以消滅其傳染源，但當群體達到一定免疫水平，即易感人群接種疫苗覆蓋率達到85%以上時，就能控制其流行。盡管人群中有少數人沒有接種疫苗，但由于群體具備足夠的免疫能力，阻斷了傳染源，這些人也可受到保護。
③全球性而局部流行或地區性傳染病用疫苗。對傷寒、霍亂、鼠疫、森林腦炎、黃熱病、斑疹傷寒等疾病，在人群中疫苗免疫有針對性，如疫區人群、常發病地區易感部分人群進行普遍接種疫苗。
④保護個體的疫苗。有些疾病只侵襲某種類型的人，或某些人感染了某種疾病后，具有很大的危險性，如流行性感冒對老年體弱的人，水痘病毒對病房體弱兒童。這類疫苗有多價滅活流感疫苗、水痘疫苗、肺炎球菌多糖疫苗、鏈球菌疫苗等。
⑤控制先天性疾病的疫苗。如風疹活疫苗。風疹病毒對受感者本身沒有多大危害，但若孕婦感染，可侵犯子宮內發育的胎兒，造成新生兒先天性畸形。
⑥有接觸某些傳染病危險的人用疫苗。如接觸狂犬病后或去疫區應接種這種疫苗。中國無黃熱病，但去非洲、南美洲的人員必須接種黃熱病疫苗。疫苗類制劑都含有抗原，接種人體后，刺激體內免疫系統細胞，產生體液免疫或細胞免疫，以防止相應病原體的感染，這種免疫稱作自動免疫。γ－球蛋白（包括一些抗毒素）是起預防作用的抗體，給人注射后可不感染相應疾病，這種免疫稱作被動免疫。由于體內的新陳代謝，所注入的抗體半衰期很短，1～2周即消失，但其優點在于生效快。各種疫苗的使用大多有一定對象，不同疫苗有不同的接種途徑。接種方法有肌肉、皮下、皮內、皮上劃痕；口服有糖丸、膠囊或液體；氣霧法分氣溶膠法（如腮腺炎活疫苗）、噴鼻法（如流感疫苗）。一般來說，濃度較大的疫苗宜采用肌肉或深部皮下注射，如果注射皮下淺層，往往局部出現硬塊或無菌化膿。皮上劃痕疫苗不可注射。皮內注射疫苗用量少，但有的可能反應較強，有的免疫持久性差。口服疫苗方法簡便，較為理想。常規用的只有脊髓灰質炎活疫苗和口服卡介苗，正在研制的有口服傷寒疫苗、口服痢疾和霍亂疫苗等。治療 用于治療的生物制品包括各種血液制劑、抗毒素和其他免疫制劑。按其作用機理可分為特異性免疫治療和非特異性治療。前者如各種抗毒素和特異的丙種球蛋白；后者如干擾素、轉移因子、白蛋白等。血液制劑是指健康人或胎盤血液經分離提純后制成的多種有效的血液成分，每種成分都有其獨特生理性能。對病人來說，除大量失血者外，絕大多數人只需要某一種或幾種成分，如甲型血友病人只缺□因子，補充□因子即可滿足需要，這樣既節省血液，又可提高療效。血漿可代替全血功能，白蛋白可代替血漿。γ-球蛋白除用于防治某些傳染病外，還可用于治療γ-球蛋白缺乏癥。干擾素有廣譜抗病毒、抗腫瘤生長、調節機體的免疫反應等多種物質活性，是免疫反應介質之一。轉移因子是細胞免疫中的重要介質，能激活細胞免疫反應，凡細胞免疫低下引起的疾病均可采用。轉移因子還可抗感染（增強細胞免疫功能），可用于治療惡性腫瘤和自身免疫病。
3、診斷制品
大都用于檢測相應抗原、抗體或機體免疫狀態，屬于免疫學方法診斷。隨著免疫學技術的發展，診斷用生物制品的種類不斷增多，不僅用于傳染病，也用于其他疾病。主要包括兩類：①診斷血清，包括細菌類、病毒立克次氏體類、抗毒素類、腫瘤類、激素類、血型及 HLA、免疫球蛋白診斷血清、轉鐵蛋白、紅細胞溶血素、生化制劑等。②診斷抗原，包括細菌類、病毒立克次氏體類、毒素類、梅毒診斷抗原、鼠疫噬菌體等。此外還有紅細胞類、熒光抗體、酶聯免疫的酶標記制劑、放射性核標記的放射免疫制劑、妊娠診斷制劑（激素類）、診斷用單克隆抗體。