原定于2005年竣工的人類30億堿基序列的測定工作（Human Genome Project，基因組計劃）由于高效測序儀的引入和商業機構的介入已經完成。怎樣利用該計劃所揭示的大量遺傳信息去探明人類眾多疾病的起因和發病機理，并為其診斷、治療及易感性研究提供有力的工具，則是繼人類基因組計劃完成后生命科學領域內又一重大課題。現在，以功能研究為核心的后基因組計劃已經悄然走來，為此，研究人員必需設計和利用更為高效的硬軟件技術來對如此龐大的基因組及蛋白質組信息進行加工和研究。建立新型、高效、快速的檢測和分析技術就勢在必行了。這些高效的分析與測定技術已有多種，如DNA質譜分析法，熒光單分子分析法，雜交分析等。其中以生物芯片技術為基礎的許多新型分析技術發展最快也最具發展潛力。早在1988年，Bains等人就將短的DNA片段固定到支持物上，以反向雜交的方式進行序列測定。當今，隨著生命科學與眾多相關學科（如計算機科學、材料科學、微加工技術、有機合成技術等）的迅猛發展，為生物芯片的實現提供了實踐上的可能性。生物芯片的設想最早起始于80年代中期，90年代美國Affymetrix公司實現了DNA探針分子的高密度集成，即將特定序列的寡核苷酸片段以很高的密度有序地固定在一塊玻璃、硅等固體片基上，作為核酸信息的載體，通過與樣品的雜交反應獲取其核酸序列信息。生物芯片由于采用了微電子學的并行處理和高密度集成的概念，因此具有高效、高信息量等突出優點。
