藥物分析的應用：質譜在藥物分析中的應用包括：合成藥物組分分析，天然藥物成分分析，肽和蛋白質藥物(包括糖蛋白)氨基酸序列分析，藥物代謝研究和中藥成分分析。在檢驗醫學中應用較多的是治療藥物監測(TDM)，以前藥物檢測主要使用免疫化學技術和高效液相色譜技術。雖然，免疫化學技術簡單易行，但是所測定藥物種類比較少。高效液相色譜技術測定藥物種類雖較多，但定性的可靠性差。然而，液相色譜與質譜(LC．Ms)聯用技術檢測藥物準確、快速，幾乎可以用于所有藥物檢測，如抗癌藥 、免疫抑制劑、抗生素以及心血管藥，LC．MS技術有望成為藥物檢測的最強有力的工具。