膿毒癥應在原發感染灶治療的基礎上，采取全身的綜合治療措施。
1.處理原發感染灶 及早處理原發感染病灶及遷徙病灶。膿腫應及時切開引流；急性腹膜炎、化膿性膽管炎、絞窄性腸梗阻應及時手術去除病因；傷口的壞死組織、異物應予去除，敞開死腔，充分引流；靜脈導管感染時，拔除導管是首要措施。
原發灶一時難以找到時，應注意潛在的感染源和感染途徑，如靜脈插管、留置尿管和腸源性感染等。疑為腸源性感染的危重病人，應及時糾正休克，盡快恢復腸黏膜的血流灌注；通過早期腸道營養促使腸黏膜的盡快修復；口服腸道生態制劑以維護腸道正常菌群等。
2.抗菌藥物的應用 可根據原發感染灶的性質，經驗性選用抗菌藥物。通常選用廣譜或聯合應用兩種抗生素。隨后根據治療效果、病情演變、細菌培養及藥敏測定等，有針對性地選用抗感染藥物。治療劑量要足，靜脈給藥。通常在體溫下降、白細胞計數正常、病情好轉、局部病灶控制后停藥。對全身真菌感染，應停用廣譜抗生素并選用酮康唑、兩性霉素B等抗真菌藥物。
3.支持療法 病人應臥床休息，給予營養豐富和易消化的食物。對不能經口進食者，可靜脈輸注葡萄糖、氨基酸和電解質溶液，必要時可應用靜脈高營養。對貧血、低蛋白血癥者可給予新鮮血、血漿以改善病人狀況，糾正水電解質及酸堿代謝失衡。原有基礎疾病，如糖尿病、肝硬化等給予相應處理等。
4.對癥處理 高熱者酌情藥物或物理降溫。嚴重病人，可用人工冬眠或腎上腺皮質激素，以減輕中毒癥狀。但應注意人工冬眠對血壓有影響，而激素只有在使用大劑量抗生素下才能使用，以免感染擴散；發生休克時，則應積極和迅速地進行抗休克療法。
5.重癥病人應加強監護 注意生命體征、神志、尿量、動脈血氣等。有血容量不足的表現應擴充血容量，必要時給予多巴胺、多巴酚丁胺以維持組織灌流。
6.抑制炎癥介質形成或阻斷介質作用的治療方法，盡管介質抑制劑治療在動物研究中證實有效，然而臨床對照研究對其有效性未獲確切的結論。
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