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  • 發布時間:2019-03-26 20:28 原文鏈接: 用隨機寡核苷酸引物從mRNA合成cDNA探針

    本方案以 poly(A) + RNA 作為模板,通過隨機引物反應合成 cDNA 探針,這類探針可用于 cDNA 文庫的差異篩選。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。

    實驗方法原理本方案以 poly(A) + RNA 作為模板,通過隨機引物反應合成 cDNA 探針,這類探針可用于 cDNA 文庫的差異篩選。
    實驗材料

    反轉錄酶反轉錄酶緩沖液隨機脫氧核苷酸引物模板 mRNA

    試劑、試劑盒

    乙酸銨DTTEDTA乙醇HClNaOH氯仿胰 RNA 酶抑制劑SDSTris-CldNTP 溶液

    儀器、耗材

    冰水浴Sephadex G-50 離心柱水浴或加熱板

    實驗步驟

    一、材料

    1. 緩沖液與溶液

    乙酸銨(10 mol/L)

    DTT (1 mol/L)

    EDTA ( 0.5 mol/L,pH 8.0)

    乙醇

    HCl ( 2.5 mol/L)

    NaOH ( 3 mol/L)

    酚:氯仿(1:1,V/V)

    胰 RNA 酶抑制劑(20 單位/μl )

    SDS ( 10% m/V)

    Tris-Cl ( 1 mol/L,pH 7.4)

    2. 酶和緩沖液

    反轉錄酶

    10X 反轉錄酶緩沖液

    3. 核酸與寡核苷酸

    含有 dATP、dGTP 和 dTTP 各 20 mmol/L 的 dNTP 溶液

    dCTP ( 125 μmol/L)

    長度為六或七個堿基的隨機脫氧核苷酸引物

    模板 mRNA

    4. 放射性化合物

    [α-32P] dCTP ( 10 mCi/ml,比活性為 >3000 Ci/mmol)

    5. 專用設備

    冰水浴

    Sephadex G-50 離心柱,平衡于 TE(pH 7.6)

    預熱至 45℃、68℃ 和 70℃ 的水浴或加熱板

    二、方法

    1. 將 1 μg poly(A)+RNA 轉移至消毒的微量離心管。用無 RNA 酶的水將溶液的體積調至 4 μl。蓋緊微量離心管蓋,于 70℃ 加熱 5 min,然后迅速將離心管轉至冰水浴中。

    2. 在微量離心管的冷溶液中加入:

    10 mmol/L DTT                                    2.5 μl

    胎盤 RNA 酶抑制劑                              20 單位

    隨機脫氧寡核苷酸引物                          5 μl

    10X 反轉錄緩沖液                                 2.5 μl

    20 mmol/L dGTP、dATP 和 dTTP 溶液  1 μl
     
    125 μmol/L dCTP 溶液                          1 μl

    10 mCi/ml [α-32P] dCTP

    ( 比活性為 > 3000 Ci/mmol)                  10 μl

    無 RNA 酶的水                                     加至 24 μl

    反轉錄酶(200 單位)                          1 μl

    3. 加入下列試劑以終止反應:

    0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0)                1 μl

    10% (m/V)SDS                          1 μl

    充分混合管中的試劑。

    4. 在反應管中加入 3 μl 3 mol/L NaOH,68℃ 溫育混合物 30 min 以水解 RNA。

    5. 使反應混合物的溫度冷卻至室溫,加入 10 μl 1 mol/L Tris-Cl(pH 7.4)以中和溶液,混勻,然后加入 3 μl 2.5 mol/L HCl。取極小量液體滴在 pH 試紙上,以檢測溶液的 pH。

    6. 用酚:氯仿抽提純化 cDNA。

    7. 用離心柱層析或在 2.5 moI/L 醋酸銨存在下用乙醇選擇性地沉淀放射性標記的探針以與未摻入的 dNTP 分離。

    8. 用三氯乙酸(TCA)沉淀法或 DE-81 濾膜結合法來確定放射性標記 dNTP 摻入的比例。


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