實驗材料 結合到谷胱甘肽-球脂糖的 GST 融合蛋白
試劑、試劑盒 堿性緩沖液 封閉緩沖液 相互作用緩沖液PK 緩沖液還原型谷胱甘肽于 Tris-Cl中洗滌緩沖液 1 洗滌緩沖液 2蛋白酶蛋白激酶 A[y-32P]ATP
儀器、耗材 與待篩選蛋白結合的膜或濾膜Sephadex G-50 轉柱
實驗步驟
材料
緩沖液和溶液
將緩沖液稀釋到適當濃度。
堿性緩沖液
20 mmol/L HEPES(pH7.5)
50 mmol/LKCl
10 mmol/LMgCl2
1 mmol/L 二硫蘇糖醇
0.1%NP-40
封閉緩沖液
5% 脫脂奶粉于堿性緩沖液中
相互作用緩沖液
1% 脫脂奶粉于堿性緩沖液中
2xPK 緩沖液
100 mmol/LKPO4(英文版原書如此—譯者注)
20 mmol/LMgCl2
10 mmol/LNaF
9 mmol/L 二硫蘇糖醇
還原型谷胱甘肽(20 mmol/L) 于 50 mmol/L Tris-Cl(pH8.0) 中
可選,請見步驟 3
洗滌緩沖液 1
磷酸緩沖鹽溶液,含 0.2%TritonX-100
洗滌緩沖液 2
磷敢緩沖鹽溶液,含 0.2%TritonX-100 和 100 mmol/LKCl
酶及緩沖液
蛋白酶
可選,請見步驟 3。
蛋白激酶 A
每次使用時按產品說明新鮮配制。
放射活性化合物
[y-32P]ATP(6000Ci/mmol)
專用設備
與待篩選蛋白結合的膜或濾膜。
請見步驟 5。
Sephadex G-50 轉柱
可選,請見步驟 4。
附加試劑
此方案步驟 3 需要一些試劑,它們可將融合蛋白從其載體上或結合的谷胱甘肽-瓊脂糖上切割下來,見 15 章方案 5。
此方案步驟 5 需要含待檢測蛋白質的聚丙烯酰胺凝膠(請見附錄 8) 或含 cDNA 表達文庫的板(請見 14 章方案 2),以及附錄 8 中描述的免疫印跡試劑。
單獨的 GST 或一種非特異性蛋白質的陰性對照應當和靶蛋白一起加入到 SDS 聚丙烯酰胺凝膠中。如果目標蛋白是一保守家族的成員,目標蛋白的相互作用可與同一家族的其他蛋白質進行比較。
載體和菌株
結合到谷胱甘肽-球脂糖的 GST 融合蛋白
這一方案適合于融合蛋白中含蛋白質激酶磷酸化位點的蛋白質(Ron and Dressler 1992)。還可采用含 cAMP 依賴的蛋白激酶識別序列的載體(Amersham Pharmacia Biotech 公司)。如果使用非標記的 GST 融合蛋白,請參見本方案結束處的文本框,“替代方案:用抗 GST 抗體檢測蛋白質-蛋白質相互作用”。
方法
放射標記蛋白探針的制備
1. 在微量離心管中制備下列反應混合物:
[γ-32P]ATP(6000Ci/mmol) 5ul
蛋白激酶 A 1unit/ul
在谷胱甘肽瓊脂糖上的 GST 融合蛋白 1~3ug
2XPK 緩沖液 12.5ul
水 到 25ul
反應混合物在 37°C 孵育 30 min。
在標記反應進行前融合蛋白可被蛋白酶切割。在此情形下,用切割蛋白替代標記反應中結合到谷胱甘肽瓊脂糖上的蛋白質,37°C 孵育 30 min, 然后接續步驟 4。
GST 成分保留在融合蛋白上,要用 GST 本身(結合到谷胱甘肽瓊脂糖)做對照重復此實驗。在文庫篩選時這可能不太實際,因此重要的是測試陽性克隆與 GST 本身結合的能力。這一對照通常在第四次純化后、克隆鑒定前進行。
2. 標記反應完成后,加入 200ul 的 1XPK 緩沖液到離心管中清洗瓊脂糖珠,然后在微量離心機上以最大速度離心 1 min。用適當的方式將含游離放射性核酸的上清棄去,再重復清洗一次。
3. 用一種蛋白酶切下標記蛋白質,或用 20 mmol/L 還原型谷胱甘肽于 50 mmol/LTris (pH8.0) 中(請見 15 章方案 5) 將標記的 GST 融合蛋白從瓊臘糖珠上洗下。將標記蛋白存放在冰盒中,在同一天中使用。
4. 在標記反應前如果標記蛋白與 GST 成分分開(請參見步驟 1 的注意事項),就將標記蛋白上用 1XPK 緩沖液平衡的SephadexG-50 柱,以除去游離的標記核酸。探針蛋白一旦與游離核酸分開,就可使用。將標記蛋白存放在冰盒中,在同一天中使用。
探測膜
5. 用標準技術將蛋白質轉移到膜上,制備待檢測的膜。
從 SDS-聚丙烯酰胺凝膠轉移的蛋白質通常可以直接被檢測。如果蛋白質從 cDNA 表達文庫中轉移,則在進入到步驟 6 之前,可要進行附加方案:“膜結合蛋白的再折疊”。
6. 用堿性緩沖液完全覆蓋膜并在 4°C 輕輕震蕩淸洗 10 min。
7. 棄去堿性緩沖液,用封閉緩沖液完全覆蓋膜,并在 4°C 輕輕震蕩孵育 4 h 到過夜。
8. 加人 1~3ug 的貯存探針(來自步驟 3 或 4) 到足夠的相互作用緩沖液中,使終濃度為 1~5nmol/L, 制備標記蛋白溶液。將膜轉移到含稀釋探針的平皿中,確認探針溶液與膜的整個表面均勻接觸。4°C 輕輕震蕩孵育 4~5 h。
9. 以適當的方式棄去放射性探針溶液。用洗漆緩沖液 1 完全覆蓋膜,并在 4°C 輕輕震蕩孵育 10 min。重復洗滌三次。
10. 用洗滌緩沖液 2 完全覆蓋膜,并在 4°C 輕輕震蕩洗滌 10 min。重復洗滌一次。
11. 用塑料包膜小心包裹膜并曝光到 X 光片上。