（1）葡萄球菌胃腸炎 金葡球菌污染淀粉類食物（如剩飯、粥、米面等）、牛奶及奶制品、魚、肉、蛋等食品后，可在室溫下（22℃左右）大量繁殖而產生耐熱的腸毒素（外毒素），100℃，30分鐘只能殺滅金葡菌而不能破壞毒素，后者可引起惡心、嘔吐、中上腹痛、腹瀉等癥狀。通常嘔吐劇烈，嘔吐物可呈膽汁性；腹瀉呈水樣便或稀便。體溫大多正常或略有升高。大多數患者于數小時至1～2天內迅速恢復，病程自限。以往認為抗菌藥物應用后所致的菌群交替性腸炎為金葡菌引起的假膜性腸炎，現已為多數學者所否定。這種腸炎乃艱難梭菌的外毒素所致，金葡菌僅為伴隨菌。
（2）中毒性休克綜合征 其主要的臨床表現為高熱、休克、紅斑皮疹、嘔吐、腹瀉，并可有肌肉痛，黏膜充血，肝、腎功能損害，定向障礙或意識改變等。該綜合征的發病系由金葡菌（噬菌體Ⅰ群）產生的致熱外毒素C引起，而與細菌本身無關。中毒性休克綜合征多見于青年婦女，尤其是應用月經閉塞者，但也發生于絕經期婦女、男性及兒童。依靠臨床表現雖可成立診斷，但血、陰道、鼻腔、尿等培養仍需進行，以觀察有無金葡菌，并排除其他病原菌感染的可能。
（3）燙傷樣皮膚綜合征 通常認為由Ⅱ群噬菌體型金葡菌所引起，此菌能產生表皮溶解毒素，引起新生兒和幼嬰兒皮膚呈彌漫性紅斑和水皰形成，繼以表皮上層大片脫落。受累部位的炎癥反應輕微，僅能找到少量病原菌。該綜合征偶可見于成人，惟皮疹很快發生脫皮，如進行合適處理，痊愈快，病死率低。
