1.短暫性腦缺血發作可出現發作性神經系統局灶癥狀體征，如一側肢體麻木、無力，通常數分鐘內完全恢復，為心臟、大動脈微栓子脫落或一過性腦血管痙攣所致。
2.偏頭痛是顱內外動脈舒縮異常引起反復發作性搏動性頭痛，典型偏頭痛視覺先兆、眼肌麻痹型或偏癱型偏頭痛需與部分性發作鑒別。偏頭痛先兆時間長，至少數分鐘，而后出現偏頭痛、嘔吐等，部分偏頭痛患者EEG可見癇性放電，但目前對頭痛性癲癇尚存質疑。
3.精神疾病復雜部分性發作有時需與精神疾病鑒別，癲癇為發作性，突發突止，發作間期精神正常。
4.前庭周圍性眩暈表現發作性視物旋轉伴嘔吐、耳鳴，可反復發作，有家族遺傳傾向者多為女性，前庭功能檢查可見一側或雙側功能降低，EEG無異常。
1.血、尿、大便常規檢查及血糖、電解質(鈣、磷)測定。
2.腦脊液檢查：顱內壓增高提示占位性病變或CSF循環通路障礙，如較大的腫瘤或深靜脈血栓形成。細胞數增高提示腦膜或腦實質炎癥，如腦膿腫、腦囊蟲、腦膜炎或腦炎繼發癲癇；CSF蛋白含量增高提示血-腦脊液屏障破壞，見于顱內腫瘤、腦囊蟲及各種炎癥性疾病導致癲癇。
1.電生理檢查：常規EEG僅可記錄到10%的部分性發作波形，40%～50%的局灶性放電波形。采用EEG監測技術，包括便攜式盒式磁帶記錄(AEEG)、視頻腦電圖及多導無線電遙測等，可長時間動態觀察自然狀態下清醒和睡眠EEG，檢出率提高到70%～80%，40%的患者可記錄到發作波形，有助于癲癇診斷、分型及病灶定位等。
2.神經影像學檢查：頭顱正側位X線平片可發現顱內異常鈣化、蝶鞍及斜坡占位性病變，鼻竇炎性或占位性病變等。CT檢查在兒童及青少年癲癇患者常見先天性腦穿通畸形、腦積水、透明隔囊腫及圍生期顱腦損傷等陳舊病灶，在成年患者常見腦缺血病灶、外傷后瘢痕、顱內占位病變、腦囊蟲或鈣化等，老年患者常見陳舊性出血或梗死、慢性硬腦膜下血腫、局限性腦萎縮等。增強可顯示腦動脈瘤、AVM、血管豐富的原發腦腫瘤或轉移瘤等。MRI檢查對癲癇患者腦病變檢出率達80%以上，與EEG記錄的癇性灶一致性為70%。1.0T以上的MRI分辨力可達3mm，可發現CT不能識別的微腫瘤，如低度惡性星形細胞瘤、神經節膠質瘤和錯構瘤等；顯示腦組織容積變化，如海馬、顳葉及半球萎縮，胼胝體缺如或增厚，灰質異位和顳中回硬化等，是某些難治性癲癇的病因。
3.單光子發射斷層掃描：(SPECT)可檢出致癇灶間歇期血流量減少，發作期血流量增加。正電子發射斷層掃描(PET)可發現復雜部分性發作致癇灶間歇期葡萄糖代謝減低，發作期代謝增加。