1、酵母菌小菌落的遺傳：啤酒酵母屬于子囊菌，它在有性生殖時，不同交配型相結合形成的二倍體合子。酵母有一種“小菌落”個體。這種類型經培養后只能產生小菌落。
如果把小菌落酵母同正常個體交配，則產生正常的二倍體合子。經減數分裂產生單倍體后代也表現正常，不再分離小菌落。這表明小菌落性狀的遺傳與細胞質有關，而且這種交后代，4個子囊孢子有2個是a+，另兩個是a－，交配型基因a+和a－仍然按預期的孟德爾比例時行分離，而小菌落性狀沒有象核基因那樣發生重組和分離，說明這個性狀與核基因無關。
進一步研究發現，小菌落酶母細胞內，缺少細胞色素a和b，還缺少細胞色素氧化酶，這些酶類，存在于細粒體中，表明這種小菌落的變異與線粒體的基因組變異有關。
2、鏈孢霉緩慢生長型的遺傳：鏈孢霉有一種緩慢生長突變型，呼吸弱，生長慢，這是由于線粒體結構和功能不正常，細胞色素氧化酶缺少，氧化作用降低，生長緩慢。
進行有性生殖時，正反交結果不同：雜交后代不出現一定的分離，表現非孟德爾式遺傳。如果突變型的單倍體核（♂）和野生型的受精絲中的單倍體核（♀）結合（雜交），得到的后代全是野生型，反之全是突變型。