磷酸奧司他韋的副作用主要包括惡心、嘔吐、腹瀉、腹痛、失眠、頭暈等。這些副作用通常是一過性的，大多數情況下不會因為藥物的使用而需要停止治療。
在臨床試驗中，成人使用磷酸奧司他韋治療流感時，最常見的不良反應是惡心和嘔吐，這些癥狀通常在第一次服藥時出現。其他常見的不良反應包括支氣管炎、失眠和頭暈。
此外，雖然發生率較低，但磷酸奧司他韋也有可能導致一些嚴重的副作用，如過敏反應、皮膚和皮下組織改變、肝臟和膽道問題等。如果在使用磷酸奧司他韋期間出現這些癥狀，應立即停止使用并尋求醫療幫助。
