香菜種子在播種之前的處理對提高種子凈度，發芽率等有十分重要的影響。處理技術的應用可以使香菜種子出苗整齊，苗壯。香菜種子處理，除使用一些通用種子處理法外，還應分析其種子特點，采取相應的綜合技術措施，才能達到目的。對于香菜種子的凈度分析可以使用種子凈度工作臺進行觀察分析。
通過種子凈度工作臺對 香菜種子進行觀測分析，可以總結出香菜種子有以下特點。這是其形態特征和所含化學成分決定的，香菜果為雙懸果，成熟時為兩個種子粒果合在一起，半果各懸于 心皮上，不再裂開。半果近似圓形，各含一粒種子，在生產上播種的“種子”實際上是果實。果實內有揮發油，外表有革質，透水性差，發芽慢。香菜種子非常小，暗褐色，圓形，表面有縱紋，有濃香昧，千粒重8克。
香菜種子在20~30℃時發芽良好，30℃以上或20℃以下發芽較慢，35℃ 以上或10℃以下基本不發芽。有光比黑暗易發芽，但不耐強光。香菜較適宜長日照。其發芽對氧氣的要求顯著高于其它種子，氧氣濃度低于80%就發育不良。香萊種子一般有5-6個月休眠期，剛收的種子不易發芽，當年發芽率只有50%一60%生產上使用第二年種子為最佳。