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  • 發布時間:2017-04-19 15:54 原文鏈接: 科學家開發出效率優于其它方法新型全基因組擴增方法

      近日,刊登在國際雜志Science上的一項研究報告中,來自哈佛大學的研究人員通過研究開發出了一種新型的全基因組擴增方法,這種方法優于當前使用的其它基因組擴增方法;在這項研究報告中,研究者對這項技術進行了描述,同時闡明了這項技術如何用于測定人類細胞暴露紫外輻射后所出現的單核苷酸改變。

      隨著科學家們不斷完全深入理解機體的基因組,新型的研究工具也在不斷誕生,其中一種研究就是探究人類機體近乎一樣的細胞之間的差異,比如胚胎細胞等,每個細胞都有自身獨特的基因組,甚至在相同的有機體中都是這種情況;此前研究中,研究者開發出了能夠放大細胞間差異的工具,這不僅能夠幫助更好地理解基因組工作的原理,還具有一定的實際應用;其中研究者就開發了一種名為MALBAC的工具來研究并且測定單一細胞間的遺傳改變,其能夠在體外受精中對胚胎進行篩查,但研究者指出,這種技術往往也受限于等位基因的丟失,而這常常會限制他們了解單核苷酸突變的過程。

      這項研究中,研究人員發現了一種新方法來改善MALBAC工具,這種改進版的工具名為LIANTI(Linear Amplification via Transposon Insertion,通過插入轉座子來實現線性擴增),該工具有千個堿基的分辨率。LIANTI能夠通過利用研究者所設計的轉座子來破碎細胞遺傳物質,轉座子就是一種特殊的DNA片段,其能夠改變在基因組中的位點,這種新型工具有19個堿基對長的轉座子結合位點以及單鏈的T7啟動子環狀結構,轉座子能夠為該工具攜帶特殊的其中自,而啟動子就能夠用來對下游的DNA進行擴增,從而產生出用于測序的文庫,早期研究結果表明,這種工具優于目前研究者所使用的工具。

      最后研究者將人類細胞暴露于紫外線下檢測了這種新型技術的作用機制,隨后對細胞所發生的改變進行了測定,這種新方法對基因組的覆蓋率能夠達到97%,這要比其它技術覆蓋率高很多。

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