立體化學作用理論的代表人物是伍斯。他認為密碼起源于氨基酸和密碼子或反密碼子（或更一般地和RNA）的立體化學相互作用。這個觀點可以追溯至1962年，伍斯推測編碼關系可能是核酸與氨基酸間的立體化學作用，他把“簡并性”中涉及的密碼子看作是相等的核苷酸，1965年5月，伍斯發表題為《密碼的規則》的論文闡明遺傳密碼的排布規則，認為利用氨基酸色譜可以為分析“簡并性”提供有用的證據，傾向于密碼關系是一種核苷酸與氨基酸間的立體化學作用。此時，普適密碼還沒有完全確立，伍斯研究的編碼關系還具有一定的推測性。事實上，全部密碼關系的最佳立體化學匹配從來也沒有被證明過。但是，氨基酸的疏水性和反密碼予3’二核苷的疏水性順序相同是已確認的事實，說明立體化學作用的因素確實重要地影響著氨基酸和反密碼子的識別。