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  • 發布時間:2014-04-15 17:07 原文鏈接: 第五屆CPSA基礎蛋白質分析會前研討會在滬隆重舉辦

      2014年4月14日,第五屆上海CPSA會前研討會——基礎蛋白質分析會議在上海復旦大學醫學院隆重舉辦,吸引來自蛋白質組研究領域的專家學者參加。本次研討會由New Objective公司贊助,與復旦大學生物醫學研究院聯合舉辦,誠邀來自Scripps Institute的John Yates博士、復旦大學楊芃原教授、New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士、國家蛋白質科學中心(上海)黃超蘭博士、華東師范大學廖魯劍教授帶來關于蛋白質研究方法、定量研究等方面的精彩紛呈的報告。分析測試百科網作為此次活動的支持媒體,對2014 CPSA會議進行全程報道。

    研討會現場

    New Objective公司中國區總裁王勇為博士

      New Objective公司中國區總裁王勇為博士上臺講話,預祝2014 CPSA圓滿召開

    復旦大學楊芃原教授

      接著,來自復旦大學的楊芃原教授上臺致辭,對參加本次研討會的各位嘉賓表示感謝,隆重介紹演講嘉賓。

    New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士

      New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士為大家帶來《什么是Spray DNA?》的演講報告。ESI即電噴霧離子源,ESI-MS是較常用的一種離子化方式,具備高濃度靈敏探測器。

      Gary Valaskovic博士在報告中指出,Spray DNA能控制整體ESI,Spray DNA具備穩定、低噪音、低RSD,高效收集,具重現性,流速高效快速和穩定等特點,同時納噴霧發射器的位置非常重要,是從液體尖部發射出去,而樣品制備,分離和離子化的整合也十分關鍵。

      同時也指出,納噴霧/LC-MS/MS關鍵技術方法開發還有部分不足有待提高,比如延遲更短、較低流速/微流控一體化等。

      最后,Gary Valaskovic博士重點介紹了New Objective公司的PicoChip產品,PicoChip易于使用,即插即用,只需一次連接,可溫控,工廠確保電壓有效連接,重現性高。

    Scripps Institute的John Yates博士

      來自Scripps Institute的John Yates博士為與會者帶來《大規模蛋白質組學的方法和數據分析》的精彩報告。

      John Yates博士指出,蛋白質組學研究是質譜、序列和電離技術的融合。從1998年研究開始,蛋白質鑒定、肽修飾、蛋白質基因組學、序列變異、搜庫等綜合完整的基因組學新技術,形成集質譜、計算群、自動化ACQ數據傳輸、生化手段、大規模分離于一體的完整蛋白質組學。

      目前還有很多蛋白質方面的問題暫無結果,但可以通過全基因組測序來解決。John Yates博士介紹了蛋白質組分析方法,包括:能對數據分析步驟的軟件工具;ProLuCID——具有卓越的靈敏度和特異性;IP2——整合蛋白質組運輸,能做到定量分析和多數據比較;定量分析工具;patternLab——功能分析工具等。

    國家蛋白質科學中心(上海)黃超蘭博士

      來自國家蛋白質科學中心(上海)質譜系統主任、中心主任助理、研究員黃超蘭博士帶來《蛋白質翻譯后修飾(PTM)分析的方法和數據處理》的精彩報告。

      黃超蘭博士指出,PTM 是蛋白質生物合成中的其中一個步驟,在蛋白質翻譯過程后發生的,是決定蛋白質功能的關鍵過程,是導致蛋白質復雜性的主要因素。現在,已經有超過300中不同類型的蛋白質翻譯后修飾,其中不少是已知在細胞生理和疾病的關鍵角色。PTM包含四種方式,添加——糖類、酯類、磷酸基團等;酶切;AAS化學性質改變;結構改變。

      報告指出,由于PTMs的不穩定性PTM緊密集中、通過得到特征離子等,可以通過對PTM MS數據的質量控制進行精確注釋,就能夠通過質譜辨別PTMs。

      最后,黃超蘭博士指出,未來PTM還有很多挑戰,比如實現PTM更高的靈敏度、更寬的蛋白豐度動態范圍等;研發更穩健的定量方法來研究PTM動態,組織和開發更多的蛋白質PTM類型分析等。

    復旦大學楊芃原教授

      來自復旦大學的楊芃原教授帶來《基于質譜強度對肽濃度的定量蛋白質組學》。楊芃原教授的報告首先從MS強度和(包含同位素峰)/理論上應該發現的肽段數提出理論思考,在肽濃度和MS響應的校正曲線。

      報告顯示一系列理論支持和實驗數據分析。qCONCAT的MRM分析,可一次表達超過20蛋白質對應肽段,并同時引進同位素標記;標準肽段和目標蛋白質酶切同步進行,可消除因樣本制備過程帶來的偏差。

    華東師范大學廖魯劍教授

      來自華東師范大學的廖魯劍教授上臺作《應用穩定同位素為基礎的定量質譜為神經系統疾病解碼的路徑》。廖魯劍教授詳細介紹了蛋白質定量方法,包括Metabolic labeling(SILAC、SILAM)、Chemical labeling(氧18)、Chemical labeling(iTRAQ、TMT、ICAT)和Label Free等蛋白質定量方法。

      會議尾聲,楊芃原教授上臺作報告總結,并感謝每一位嘉賓的精彩演講。

      會后,CPSA創建者Mike Lee先生和New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士與每一位演講嘉賓合影留念。

    CPSA創建者Mike Lee先生、New Objective公司總裁Gary Valaskovic博、Scripps Institute的John Yates博士合影

    CPSA創建者Mike Lee先生、New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士、復旦大學楊芃原教授合影

    CPSA創建者Mike Lee先生、New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士、國家蛋白質科學中心(上海)黃超蘭博士合影

    CPSA創建者Mike Lee先生、New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士、華東師范大學廖魯劍教授合影

    CPSA創建者Mike Lee先生、New Objective公司總裁Gary Valaskovic博士、復旦大學生物醫學研究院化學系金紅博士合影

    集體合影

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