發病機制包括：反流物直接刺激、氣道微吸入、迷走神經反射等
1.局部刺激：在沒有誤吸的情況下，通過刺激咽喉部局部粘膜刺激而刺激咳嗽反射的傳入而引起咳嗽；
2。吸入刺激：反流物的吸入刺激下呼吸道而引起咳嗽（微量誤吸可導致咽炎、支氣管炎；大量誤吸可以引起肺吸入綜合征、昔日性肺炎、肺纖維化、支氣管擴張等）；
3.神經反射：刺激食管-支氣管咳嗽反射引起慢性咳嗽。胃內酸性消化液反流入食管下段，刺激呼吸道迷走神經，引起平滑肌痙攣發生氣喘不止。
