應避免妥布霉素吸入溶液與其他具有神經毒性、腎毒性或耳毒性的藥物同時和/或序貫使用。
一些利尿劑可以改變血清和組織中氨基糖苷類藥物的濃度，從而增強其毒性。因此，妥布霉素吸入溶液不應與依地尼酸、呋塞米、尿素或靜脈內甘露醇合并使用。尚未評估吸入甘露醇和妥布霉素的藥物相互作用。
應避免本品與肌肉松弛劑（如A型肉毒桿菌毒素）合用，兩者對神經肌肉接頭均有阻斷作用，合用時作用增強，可能會抑制患者呼吸。
