恩替卡韋副作用主要表現在以下幾個方面：
1、在國外進行的研究中，恩替卡韋片的主要副作用表現為：頭痛、疲勞、眩暈、惡心。少見不良反應包括嘔吐，嗜睡或者睡眠困難等癥狀，影響患者的生活質量。
2、在中國進行的臨床試驗中，恩替卡韋片的副作用有：ALT升高、頭痛頭暈、疲憊、眩暈、惡心、腹痛、腹瀉、腹部不適、肌痛、失眠、風疹和消化不良，也可見于中性粒細胞輕度下降等，這些不良反應多為輕到中度。
3、單獨使用或者與其它抗逆轉錄病毒藥物聯合使用時，可能會導致乳酸性酸中毒和重度的脂肪性肝腫大，甚至死亡。
4、不能隨時停藥，否則可能會導致病情惡化。