細菌性疾病臨床上一種細菌可以感染不同部位而引起不同疾病，例如金葡菌可以引起皮膚、軟組織感染，也可引起肺炎、骨髓炎、腦膜炎、敗血癥或心內膜炎等；產腸毒素金葡菌可引起食物中毒；一種產特殊外毒素(TSST-1)的金葡菌可引起中毒性休克綜合征。此外，不同細菌又可以引起相似的臨床表現，例如大腸桿菌、肺炎桿菌、流感桿菌等都可引起肺炎、腦膜炎、敗血癥等；金葡菌、α溶血性和非溶血性鏈球菌、腸球菌、產堿桿菌、綠膿桿菌等都可引起感染性心內膜炎。
