從膽汁的生成、分泌到排泄，任何一個環節出現問題都可能導致膽汁淤積。正常膽汁的形成和分泌是一個復雜的過程，其并不是依靠流體靜壓的作用，而是一個需要耗能的主動排泌過程，歷經肝細胞水平的攝入與分泌、膽管內皮細胞水平的分泌及腸內皮細胞水平的重吸收過程。現如今發病機制已基本明確，大致包括：肝竇基側膜和毛細膽管膜的改變、肝細胞骨架的改變、膽汁分泌調節異常、緊密連接損傷、毛細膽管和肝內膽管的阻塞等。
