脂肪干細胞來源于中胚層，現已證明其具有向骨、軟疾病種類臨床階段骨、脂肪、肌腱、神經、內皮細胞、肝細胞和造血方向分化的潛能。例如，脂肪干細胞治療心肌梗死的可能機制包括以下幾個方面：
①向心肌細胞、血管內皮細胞分化，直接修復壞死心肌細胞。脂肪干細胞能通過減少心臟重塑，增加血管生成來提高心肌梗死后心功能恢復。
②內分泌功能，可以通過促進毛細血管以及小動脈的生長來減輕心肌梗死后心臟的損傷以及提高心功能恢復。
③外源性保護因子的作用載體。脂肪干細胞可能成為外源性基因在心肌梗死后心臟內表達的有效載體，對心功能的恢復有很大幫助。