1、尿路感染
反流使部分尿液在膀胱排空時逆行向上，為細菌從膀胱上行至腎盂提供了通路。因此反流常并發尿路感染，可出現急性腎盂腎炎的臨床癥狀和無癥狀的慢性腎盂腎炎的病理過程。有學者發現腎瘢痕者97%有膀胱輸尿管回流現象，而重度反流在小嬰兒中更易產生腎瘢痕。
2、腎瘢痕
在有反流的患兒中，有30%～60%發生腎實質瘢痕，腎瘢痕的程度與反流的嚴重度呈正比。Smellie等將腎瘢痕分為4級：
A級，僅有1～2個腎實質瘢痕。
B級，較廣泛的不規則的瘢痕。
C級，全部腎實質變薄，伴廣泛的腎盞變形。
D級，腎萎縮。