由于HIV為艾滋病的致病因子，機體一旦受感染后，就會引起免疫系統的破壞，因此，艾滋病在發病過程中就會引起各種病因的機會性感染及腫瘤等合并癥，而且合并癥又能再繼發合并癥，如Kaposi肉瘤可同時合并中樞神經系統感染，艾滋病患者由于免疫功能低下，尤其晚期，不但常繼發其他疾病，而且可致多器官衰竭(MOSF)，繼發代謝性腦病。
