同時應用其它中樞神經系統抑制劑，包括阿片類藥物，鎮靜劑，催眠藥，全身麻醉劑、酚噻嗪類藥物，安定類藥物，肌肉松弛藥，鎮靜性抗組胺藥及酒精飲料，可產生附加的抑制作用。可能發生肺通氣不足，低血壓及深度鎮靜或昏迷。因此，在合并使用上述藥物時，應對患者進行特別護理和觀察。
芬太尼是一種高清除率的藥物，主要由CYP3A4迅速和廣泛代謝。將芬太尼透皮貼劑與CYP3A4抑制劑合用，會使芬太尼血漿濃度升高，從而加強或延長芬太尼的治療效果和不良反應，也可能引起嚴重的呼吸抑制。此種情況下，應對患者進行特別護理和觀察。只有在嚴密監測下，芬太尼透皮貼劑才可與CYP3A4抑制劑合用。
單胺氧化酶抑制劑（MOAI）
一些接受單胺氧化酶抑制劑治療的患者，靜脈注射麻醉劑時發生嚴重的不良反應。一些報告指出，同時使用單胺氧化酶抑制劑和靜脈注射芬太尼沒有問題。但是，由于患者數量很有限，還無法定論。因此，所有使用單胺氧化酶抑制劑治療的患者都被視為使用麻醉劑(包括芬太尼)的高危人群。本品不推薦用于需要使用單胺氧化酶抑制劑的患者。有與單胺氧化酶抑制劑合用發生嚴重的藥物相互作用的報告，包括加重阿片作用和5-羥色胺能作用。因此，在停止使用單胺氧化酶抑制劑后的14天內，不應使用本品。