重組酵母乙肝疫苗與血源乙肝疫苗具有相同的血清學效果。在阻斷母嬰傳播方面,重組酵母乙肝疫苗明顯優于血源乙肝疫苗,3劑5μg只支可阻斷母嬰傳播率95%以上。這兩種疫苗可以互相使用,即用血源乙肝疫苗接種第1針、第2針免疫接種的人,可以用重組酵母乙肝疫苗完成第2或第3針免疫接種,反之亦然。