多數生物體中的非編碼基因（ncRNA）被轉錄為需要進一步加工的前體。核糖體RNA（rRNA）通常被轉錄為含有一個或多個rRNA的前體rRNA,前體rRNA后來在特定位點被大約150種不同的snoRNA切割和修飾。轉移RNA（tRNA）的5'和3'端序列分別被RNase P和tRNase Z去除,然后通過核苷酸轉移酶加入在3'加上非模板CCA尾巴。小RNA（miRNA）首先被轉錄為具有帽和poly-A尾的初級轉錄物即pri-miRNA,然后在核內被Drosha和Pasha酶加工成短的約70個核苷酸的莖環結構,即pre-miRNA。在輸出到細胞質中后,內切核酸酶Dicer將其加工成成熟miRNA. pre-miRNA和Dicer的相互作用同時也啟動了由Argonaute蛋白組成的RNA誘導的沉默復合物（RISC）的形成。