對急性EBV感染引起的神經系統并發癥，一般給予支持治療，包括抗癲癎藥物和機械通氣，應慎用補液以避免腦水腫。有顱內壓增高者可給予腎上腺糖皮質激素，對沒有傳染性單核細胞增多癥患者給予激素可縮短發熱與咽痛時間，但不能不減輕淋巴結和脾臟腫大，沒有顱內高壓的神經系統并發癥患者，如腦脊髓炎、小腦共濟失調、橫斷性脊髓炎或周圍神經質病等，應用激素有一定作用。但在傳染性單核細胞增多癥患者，應用激素可能誘發新的神經系統癥狀，而且可使急性感染性多神經根炎預后更差，因此激素僅適用于某些特定患者。
阿昔洛韋在體外可抑制EBV的復制，但臨床研究顯示阿昔洛韋對急性傳染性單核細胞增多癥無明顯療效。對免疫抑制者所患的CNS并發癥，聯合應用阿昔洛韋和激素對減少病毒復制可能有一定作用。