目前類器官的培養主要是指上皮細胞類器官, 如消化道上皮細胞、乳腺上皮細胞、皮膚上皮細胞、肺泡上皮細胞等, 大部分的類器官中只有上皮細胞, 不含有成纖維細胞、免疫細胞、血管細胞等周圍基質細胞. 這在很大程度上限制其在其他領域的應用, 如免疫防御的研究、干細胞微環境、腫瘤微環境調控方面的研究. 今后的研究如能把血管內皮干細胞、成纖維干細胞、上皮干細胞等共培養, 將能夠最大程度地模擬體內組織微環境;
當然, 類器官培養技術的發展才剛剛開始, 仍面臨著一些需要解決的問題。一方面, 類器官培養體系與活體相比缺少腫瘤微環境成分(如免疫細胞和血管內皮細胞), 并不能完全代表腫瘤在體內所處的環境。另一方面, 在類器官的培養體系中含有眾多組分, 其中包括多種通路抑制劑和細胞因子, 而這些組分之間存在著功能上的聯系, 甚至在要研究的目的信號通路中也扮演著重要角色。所以, 未來更需要結合臨床實踐, 發展新一代的類器官培養體系。總的來說, 類器官在基因水平和形態特點上能夠很好地模擬患者體內相應的組織, 也適用于高通量的藥物篩選, 同時為疾病的個性化治療提供了研究模型。相信隨著類器官研究的不斷深入和技術的不斷革新, 類器官作為一種理想的模型在人類研究癌癥的征途上將會扮演越來越重要的角色。