做精液的生化檢查時，精液標本要置于35℃-37℃水浴箱內，液化后取1.2-1.5ml離心15 分鐘，取上層精漿作生化測定。該項檢查目前開展較多的是果糖、微量元素、檸檬酸、蛋白質、酸性磷酸酶、乳酸脫氫酶x等。
(1) 果糖的測定：一般用間苯二酚法，正常值為256±104mg/dl。果糖主要由精囊分泌，為精子能量代謝的主要來源，與精子活率有關。果糖為零，應考慮精囊缺如。精囊有炎癥時，果糖含量下降。此外，雄激素不足及老年時果糖含量降低，糖尿病時精漿中果糖含量較高。
(2) 微量元素：對男性生殖和生殖內分泌功能有重要作用。正常精液中鋅為130±5 6μg/ml ，銅：1.85±0.15μg/ml，鐵：0.81±0 04μg/ml。精液中的鋅能影響精子代謝，和精子活動力、密度成正比關系，且能通過影響腦垂體再間接地影響性腺，當鋅不足時，垂體促性腺激素分泌減少，使性腺發育不良，或使性腺的生殖和內分泌功能發生障礙。銅能影響精子存活率及活動度，精液中銅濃度高，精子活動度較差。
(3) 檸檬酸：通過furth herrmann反應測定，正常值為5 6±2.0mg/dl，主要來自前列腺，調節精液中鈣離子濃度，影響精液的液化，具有前列腺酸性磷酸酶激活劑作用，從而影響精子活力。前列腺有炎癥時，檸檬酸含量顯著減少。
(4) 蛋白質：用雙縮尿法測定。正常人為3.6±0.8g/dl。精液中的蛋白質主要來自精囊、前列腺，可促進精子活力，保護精子免受環境的有害作用。
(5) 酸性磷酸酶：用β甘油磷酸法測定。正常值為882±412布氏單位/ml。該酶主要來自前列腺。與精子的活力和代謝有關。前列腺炎時，精漿中酸性磷酸酶含量下降；早期前列腺癌或良性前列腺肥大，酸性磷酶含量常增高。
(6) 精子特異性酶—乳酸脫氫酶同功酶具有相對的組織特異性，與生精功能有一定關系。