糖原由D-葡萄糖的分支或直鏈組成，在肝和肌肉最豐富。過碘酸是一種強氧化劑，能將葡萄糖中乙二醇基（CHOH-CHOH）氧化成二個游離醛基（—CHO），游離醛基與Schiff's試劑反應生成紫紅色產物，顏色深淺與多糖含量成正比。
由于單糖在固定、脫水和包埋等組織化學操作過程中被抽提掉，故一般組織標本上所能顯示的糖類主要是多糖，包括糖原、粘多糖、粘蛋白、糖蛋白和糖脂等。因此要確定此紅色物質是否糖原還需要同時進行對照實驗。
糖原可被唾液淀粉酶水解，先用唾液淀粉酶作用再進行PAS顯色，若反應為陰性，則表明是糖原，反之則為其他多糖。