多能干細胞(Pluripotent stem cells, PSCs)因其在體外具有無限增殖和分化為不同類型細胞的潛能,在再生醫學領域中具有廣泛應用前景,也成為目前臨床上最具潛能的成藥細胞。PSCs制備過程中的標準化、規模化及細胞質量穩定性是其走向臨床應用的先決條件.但人PSCs在體外擴增培養過程中,易出現遺傳和表觀遺傳的變異,嚴重阻礙了PSCs的臨床應用(1)。因此,研究PSCs遺傳物質穩定性維持機理,是尋找改善策略、突破應用瓶頸的關鍵。
PSCs基因組的突變率遠低于分化細胞。鄭萍團隊和其他團隊的前期研究表明,PSCs利用不同于體細胞的特殊機制,有效調控基因組穩定(2)。鄭萍組前期已鑒定了PSCs在DNA復制、DNA損傷修復中的一些特殊分子及作用機制(3-6)。近期鄭萍組鑒定了一個在小鼠胚胎干細胞(mouse Embryonic Stem cells, mESCs)中特異表達的全新長鏈非編碼RNA-LncRNA NONMMUT028956 (簡寫為Lnc956)。對該LncRNA的系統研究發現它不僅參與復制壓力下mESCs復制小體穩定的維持,而且還監控mESCs基因組的質量,從而確保mESCs基因組穩態。
長非編碼RNA在多種生物學功能中起重要作用。由于技術手段的限制,目前還沒有發現復制叉上具有功能性長非編碼RNA的報道。研究團隊利用前期研發的一個新技術-分離新生DNA鏈上(即復制叉)RNA技術(isolate RNAs on nascent DNA ,iROND)首次鑒定了ESCs復制叉上特異的新的功能性LncRNA-Lnc956。對該LncRNA的研究發現,當復制壓力發生時,Lnc956能有效聚集到復制叉上,并大量招募Trim28和Hsp90b1聚集于復制叉形成復合體。Trim28能直接與DNA復制解旋酶復合體MCM2-7相互作用,直接拉近了Lnc956-Trim28-Hsp90b1復合體與MCM2-7復合體之間的物理距離,使得分子伴侶Hsp90b1通過其GTP水解活性作用于MCM7,阻礙MCM7進行K48和K63泛素化(MCM7泛素化會導致復制小體解離),從而使得復制小體能在一定程度復制壓力情況下得以穩定,保持了基因組的完整性(圖1)。我們也發現Lnc956缺失會導致小鼠胚胎部分致死,致死原因主要是胚胎細胞大量擴增過程中,細胞出現明顯基因組不穩定現象,并導致胞質DNA水平顯著增加,引起較嚴重的炎癥反應。總之,該研究結果首次發現了小鼠多能干細胞復制叉上特異性功能性長非編碼RNA-Lnc956,并揭示了Lnc956維持多能干細胞基因組穩定和促進胚胎發育的分子機制。
開啟或關閉基因的能力是我們在細胞、個體甚至在健康和疾病方面觀察到的多樣性的基礎。這個過程被稱為基因轉錄,涉及到將儲存在我們的DNA中的信息轉化為RNA。在此之前,科學家們一直依靠不精確的圖解和間接的實......
美國哈佛大學醫學院團隊設計了一種人工智能(AI)醫療工具,可快速解碼腦腫瘤的DNA,以確定其在手術過程中的分子身份,而現有方法需要幾天甚至幾周的時間才能獲得這些關鍵信息。研究成果7日發表在《醫學》雜志......
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術,可誘導單個堿基的突變,而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外,關于堿基編輯系統與染色質環境之間......
成語有云:畫蛇添足,形容做事多此一舉。但蛇真的無腳嗎?爬行動物專家認為,蛇的祖先是蜥蜴,在遠古時期,蛇是有腳的,只是在演化過程中慢慢失去了。近日,這一說法得到了進一步證實。經過5年的研究,基于大規模多......
日前,由復旦大學、西安交通大學等國內26個科研單位聯合開展研究,繪制出了基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜,相關成果于北京時間14日在國際權威學術期刊《自然》雜志發表。這也是我國科學家首次自主進行......
谷子即小米,起源于中國,作為糧食作物深受老百姓喜愛。近日,中國農業科學院作物科學研究所特色農作物優異種質資源發掘與創新利用團隊,通過對谷子種質資源的基因組分析,組裝了首個谷子高質量圖基因組,系統闡明了......
密歇根州的酸櫻桃產量在全美名列前茅,密歇根州立大學的一個研究小組啟動了一個項目,旨在確定與酸櫻桃樹晚開有關的基因,以滿足不斷變化的氣候的需要。他們首先將晚開的櫻桃樹的DNA序列與一個相關物種--桃子的......
一種50多年前收集并在實驗室中生長的單細胞藻類,原來是一個由曾經獨立的生物組成的奇怪的集合體,里面有不少于7個不同的基因組。4月27日,相關成果發表于《當代生物學》。“據我所知,單個細胞中有7個不同的......
人類約有2萬個基因,僅占DNA的2%,剩下的98%是什么?這些區域如同基因組中的“暗物質”,有待科學家去發現。非編碼RNA(核糖核酸)是基因組“暗物質”中的一類重要分子,最近十幾年才被發現。它們不僅在......
科學家們發現了Spirostomum的超快收縮的分子基礎,Spirostomum是一種以令人難以置信的快速運動而聞名的毫米級單細胞原生動物屬。利用從RNAi獲得的高質量基因組,研究人員發現收縮結構,即......