今年2月,英國Oxford Nanopore Technologies公司(以下簡稱Oxford)宣布推出一款便攜式的基因組測序儀MinION,約摸只有U盤大小,價格低于900美元,立即引發市場轟動。同時,該公司另一測序平臺GridION有望在15分鐘內完成人類基因組測序,費用約為1,500美元。
然而,大半年過去了,納米孔測序儀卻遲遲不見蹤影。Oxford也真是沉得住氣啊,未透露一點消息,難道他們也在學蘋果?這下,輪到生物界的業內人士坐不住了。
Warp Drive Bio生物技術公司的首席科學家Keith Robison在他的博客中寫道,Oxford一直很安靜,除了籌集到一些資金外,既沒有公布任何數據,也沒有任何跡象表明測試系統已安裝。而另一家專注于納米孔的公司Genia日前獲得一項納米孔測序技術授權,計劃在2014年推出商業化產品。Keith Robison問道,納米孔何時才能真正推出市場?
同時,美國東北大學的Meni Wanunu在《Physics of Life Reviews》上發表綜述文章,質疑現有的技術障礙是否能夠克服。
納米孔測序的想法在90年代中期提出,之后取得了重大進展。基本原理很簡單:讓單鏈DNA穿過一個微小的孔(納米孔),在它們穿過孔的同時依次鑒定各個DNA堿基。
根據Wanunu的文章,納米孔測序的主要挑戰是讓這個過程慢下來,控制DNA鏈穿過孔的速率足夠慢,以便可讀取和利用單個DNA堿基。一種利用酶控制運動的新方法的開發就是為了克服這一問題,但也有其自身的缺點,包括酶活性較差,導致持續能力有限且正向反向運行不受控制。
另一個主要問題是蛋白質或固態孔是否提供了最有前途的技術。最初,人們研究了天然存在的多孔蛋白。但在2000年后,人們測試了各種由硅或石墨烯組成的固態納米孔,認為其提供了更好的功能和靈活性。但Wanunu認為,蛋白通道和固態納米孔都有缺點,在未來幾年,看看那些設備或設備組合出現,也許很有趣。
Wanunu還補充道,納米孔測序仍有許多障礙需要克服,包括納米孔無法提供關于分子特性的光譜信息,不確定易位是否以恒定速度發生,以及孔堵塞的并發癥。
美國國家標準與技術研究院的John Kasianowicz,同樣也是這一領域的先驅,在同一期雜志上發表評論,認為許多挑戰仍然存在。“的確有許多問題需要解決,才能開發出切實可行的電子納米孔檢測設備。然而,通過更好地理解這一新興領域的發展道路,這一旅程將不那么讓人生畏。”
若您本來有購入納米孔測序儀的打算,如此看來還需要耐心的等待哦。
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