組織印跡的Western雜交
在硝酸纖維素膜上制備組織印跡
1．在塑料板上放置兩層Whatman 1號濾紙，在濾紙上方放上一張普通紙，然后鋪上一層硝酸纖維素膜。
2．用雙面刀片從植物組織如大豆的莖上切取一塊切片（厚度約為 1mm）。如果組織表面是濕的，則在Kimwipes紙上輕輕吸干或用蒸餾水洗滌幾秒鐘然后再用Kimwipes紙吸干。用鑷子將組織切片轉移到硝酸纖維素膜上，注意一旦將切片放置在膜上以后就不得再移動切片。在切片上放置4層Kimwipes紙，用手指輕輕壓15到20秒，用鑷子小心拿開紙和組織切片。組織切片經甲苯酸藍染色后觀察其解剖結構。
3．將留有組織印跡的硝酸纖維素膜在空氣中晾干。
4．將留有印跡的膜面向下，放入載玻片上的一滴甲苯酸藍溶液中，對組織切片進行染色。2～3分鐘后，吸干多余的染料，用間接照明立刻照相。將載玻片翻轉，透過玻璃拍攝染色的組織切片。在切片上粘上幾張紙片以免組織切片接觸顯微鏡。
用特定的抗體檢測組織印跡中的蛋白質（室溫下）
1．在淺碟子里倒入30～40ml洗滌緩沖液I，清洗留有印跡的硝酸纖維素15分鐘。
洗滌緩沖液I：
0.1mol/L Tris-HCl(pH8.0)
0.05%疊氮化鈉
0.3％ Twen-20
2．將膜轉移到 15ml印跡緩沖液中，培育3小時。
3．把膜轉入10ml用印跡緩沖液稀釋的初級抗體溶液中，培育2小時。
4．在 40ml洗滌緩沖液I中清洗硝酸纖維素膜10分鐘，換上新鮮緩沖液，重復清洗3次。
5．將膜轉入10ml用印跡緩沖液稀釋的與堿性磷酸酶結合的二級抗體溶液中，培育1小時。
6．在40ml洗滌液I中清洗硝酸纖維素膜10分鐘。
7．在40ml洗滌緩沖液Ⅱ中清洗硝酸纖維素膜15分鐘，換上新鮮緩沖液，重復清洗1次。
洗滌緩沖液Ⅱ：
0.1 mol/L Tris-HCl(pH8.0)
0.05%疊氮化鈉
0.3% Tween-20
0.05%十二烷基硫酸鈉
8．在40ml洗滌緩沖液I中清洗硝酸纖維素膜10分鐘，然后用AP緩沖液平衡10分鐘。
AP緩沖液
0.1 mol/L Tris-HCl (pH9.5)
0.1 mol/L NaCl
5 mmol/L MgCl2
9．在顯色反應中，將膜放入10ml含有66μl氯化硝酸藍四唑和33μl 5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸的AP緩沖液中，兩者均為堿性磷酸酶底物。目的蛋白所在處將出現紫色。通常顯色10分鐘即可獲得滿意的結果。如果需要更長時間的顯色反應，必須在黑暗中進行。
10． 在20ml洗滌緩沖液Ⅱ中清洗硝酸纖維素膜5分鐘，終止顯色反應。用40ml蒸餾水洗滌5分鐘后在空氣中晾干。
11． 在解剖顯微鏡觀察組織印跡中被染上色的蛋白質。利用透射光和入射光可成功的觀察到蛋白質的定位模式。在入射光下可容易觀察到物理印跡。為了確認組織印跡中的蛋白質定位，建議將染色的組織印跡和用甲苯酸藍染色的組織切片進行直接比較。