在虛擬的培養皿中，熒光細胞被標記為綠色小球，通過微量吸液管對細胞進行提取。控制臺通過物鏡環固定在物鏡上方，玻璃微量吸液管被固定在控制臺中心光軸位置。微量吸液管頂端通過LED 燈照射，照射光通過微量吸液管直接被引入到物鏡。微量吸液管尖端可通過手動調節彈簧旋鈕上下移動到物鏡焦點位置。
培養皿可以進行水平移動，微量吸液管上端通過撓性導管連接到注射泵上。
自動細胞分選儀控制臺可通過計算機USB 接口控制流體閥和顯微LED 照明光源，同時也可以自由地控制顯微鏡熒光快門，并且整合了高速控制閥實現流體快速、精密控制。