細菌耐藥性（Resistance to Drug ）又稱抗藥性，系指細菌對于抗菌藥物作用的耐受性，耐藥性一旦產生，藥物的化療作用就明顯下降。耐藥性根據其發生原因可分為獲得耐藥性和天然耐藥性。
自然界中的病原體，如細菌的某一株也可存在天然耐藥性。當長期應用抗生素時，占多數的敏感菌株不斷被殺滅，耐藥菌株就大量繁殖，代替敏感菌株，而使細菌對該種藥物的耐藥率不斷升高。為了保持抗生素的有效性，應重視其合理使用。
細菌耐藥性是指細菌對抗菌藥物不敏感的現象，是細菌自身生存過程中的一種特殊表現形式。細菌耐藥性可分為固有耐藥性和獲得性耐藥性。
天然抗生素是細菌產生的次級代謝產物，用于抵御其他微生物，保護自身安全的化學物質。人類將細菌產生的這種物質制成抗菌藥物用于殺滅感染的微生物，微生物接觸到抗菌藥，也會通過改變代謝途徑或制造出相應的滅活物質抵抗抗菌藥物。