1.嚴重聯合免疫缺陷病
臨床上多于出生后3個月內開始感染病毒、真菌、原蟲和細菌，反復發生肺炎、慢性腹瀉、口腔與皮膚念珠菌感染及中耳炎等。患兒生長發育障礙。體檢一般不見淺表淋巴結和扁桃體。胸部X線檢查不見嬰兒胸腺陰影。給患兒輸入含免疫活性淋巴細胞的全血，會發生移植物抗宿主病。網狀組織發育不全是SCID的最重型。其特點是T、B系統免疫缺陷與嚴重粒細胞缺乏。大多因鏈球菌膿毒血癥而于生后一周內死亡。SCID還可伴發骨發育不全，而導致短肢侏儒，并有毛發早脫、紅皮病和魚鱗癬等損害。伴腺苷脫氫酶（ADA）缺乏的SCID為常染色體隱性遺傳，臨床表現與普通SCID相似，但骨損害較多，常累及肋軟骨連接處、脊椎、骨盆和肩胛骨。
2.伴有血小板減少及濕疹的免疫缺陷病
男性發病。出生后即有血小板減少，常以出血為首發癥狀。血小板顯著減少，可低至（10～30）×10/L。6個月后發生感染者多見，且隨年齡而加重。病原體為嗜血性流感桿菌、肺炎球菌、白色念珠菌、卡氏肺孢子蟲、皰疹病毒等。濕疹常在1歲左右發生，此外，常伴發過敏性疾病，如哮喘及蕁麻疹。常發生自身免疫疾病，如幼年型類風濕關節炎、血管炎以及溶血性貧血。10歲以上兒童還可發生惡性疾病，如淋巴瘤和急性淋巴細胞性白血病。
3.共濟失調毛細血管擴張癥
臨床上在9～12個月時出現共濟失調，也可遲至4～6歲才出現。毛細血管擴張癥通常在3～6歲時出現，也可早在2歲或遲至8～9歲出現，病程呈進行性，隨年齡的增長，神經系統癥狀和免疫缺陷也隨之加劇。兒童期可出現鼻竇和呼吸道反復感染。青春發育期很少出現第二性征，大多數患者有智力發育障礙。有的患者可發生抗胰島素的糖尿病。常并發淋巴網狀系統惡性腫瘤和其他腫瘤。
4.伴免疫球蛋白合成異常的細胞免疫缺陷病
又稱Nezelof綜合征。臨床上多在嬰兒晚期或幼兒期出現癥狀，主要有反復感染，可發生卡氏肺孢子蟲病、風疹病毒、巨細胞病毒感染。可有淋巴腫大，慢性肺部真菌感染及惡性腫瘤。