1、聚丙烯酰胺凝膠是由丙烯酰胺單體（以后簡稱單體）在水溶液中聚合而成的親水性高聚物，是一種透明而不溶于水并有韌性的凝膠。
2、制備凝膠時需要的原料是：丙烯酰胺，亞甲基雙丙烯酰胺（雙體，用作交聯劑）在水溶液中用催化劑引發聚合。常用的催化劑有：二甲氨基丙腈（DMAPN）；過硫酸銨，四甲基乙二胺；過硫酸銨或加核黃素后用紫外光（波長253．7毫微米）引發聚合。
3、聚合時丙烯酰胺分子通過加成反應形成長鏈，雙體的作用是在長鏈之間形成交聯，成為具有三維網狀結構的凝膠。所以在凝膠電泳中除了具有電泳的分離外還具有分子篩作用，從而增高了它的分辨能力。
4、聚合時，根據分離的需要，可以用改變單體溶液濃度或增減雙體比例的辦法制成孔度大小不同的凝膠。在分離血清蛋白時，采用的丙烯酰胺總濃度為6.5%，內含單體96%，雙體4.5%。
5、聚合物分子中含有很多酰胺基，所以凝膠具有良好的親水性，能在水中溶脹但不溶解。