1.神經源性肌萎縮
常見的原因為廢用、營養障礙、缺血和中毒。前角病變、神經根、神經叢、周圍神經的病變等均可引起神經興奮沖動的傳導障礙，從而使部分肌纖維廢用，產生廢用性肌萎縮。另一方面當下運動神經元任何部位損害后，其末梢部位釋放的乙酰膽堿減少，交感神經營養作用減弱而致肌萎縮。
2.肌源性肌萎縮
是由肌肉本身疾病，可能還包括其他一些因素，如肩帶或面肩肱型的肌營養不良患者，通過形態學檢查證實為脊髓型肌萎縮。用微電極技術檢查患肌營養不良的動物，顯示機能性失神經肌纖維者約占1/3。
兩大類主要因素可以引起“肌萎縮”：神經受損稱神經源性肌萎縮；肌肉本身的疾病稱肌源性肌萎縮。