左右肝管匯合形成肝總管。右肝內膽管分為右前葉肝管、右后葉肝管；左肝內膽管分為左內葉肝管及左外葉
肝管。肝內膽管結石易發生于左肝管起始部，肝管狹窄伴管腔擴張、堆積結石。還多見于右前、后肝管匯合成右肝管開口處，膽管結石堆積。正常膽道在PTC、ERCP時直徑0.7～1.0cm，管徑<0.06cm考慮硬化性膽管炎，管徑>1.0cm考慮膽道梗阻，病因為膽管結石、腫瘤、乳頭良性狹窄等。肝內膽管輕度狹窄指膽管最大直徑超過最小直徑1倍以下。重度狹窄指膽管最大直徑超過最小直徑1倍以上。
肝內膽管結石幾乎全是膽紅素鈣石，由膽紅素、膽固醇、脂肪酸與鈣組成。可為雙側肝內膽管結石，也可限于左肝或右肝，左肝內膽管結石較右肝多見。
肝內膽管結石與肝內膽管狹窄、擴張并存，因此有膽汁的滯留。狹窄于兩側肝管均可見到，以左側多見，也可見于肝門左、右肝管匯合部。少數病例僅有肝內膽管結石并無膽管狹窄。
