肽鍵具有特殊性質。從鍵長看,肽鍵鍵長(0.132nm)介于C—N單鍵(0.146nm)和雙鍵(0.124mm)之間,具有部分雙鍵的性質,不能自由旋轉;從鍵角看,肽鍵中鍵與鍵的夾角均為120°。因此,與肽鍵相連的6個原子(Cn、C、O、N、H、Ca)始終處在同一平面上,構成剛性的“肽鍵平面”,又稱“酰胺平面”或肽單元。肽單元中,與C—N相連的氫和氧原子與兩個碳原子呈反向分布。
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