1.高位小腸扭轉
本病最易和胃扭轉發生混淆，但高位小腸梗阻的嘔吐較胃扭轉急劇、頻繁，且量較多，并含有膽汁，同時小腸扭轉所致的腹痛較胃扭轉劇烈，呈持續性，有腸鳴音亢進，腹部X線片表現也不同，可鑒別。
2.急性胃擴張
本病以上腹脹痛為主，腹痛不嚴重。有惡心及頻繁無力的嘔吐；嘔吐物含膽汁，量多。胃管易插入，并能抽出大量液體和氣體。患者有脫水及代謝性堿中毒，早期出現休克。
3.急性胃炎
本病有突發上腹疼痛，并伴有嘔吐，易和急性胃扭轉發生混淆，故應注意鑒別，其鑒別要點如下：①本病嘔吐較急性胃扭轉頻繁，量較多，可混有膽汁，而胃扭轉不含有膽汁；②本病可插入胃管，而胃賁門完全性扭轉不能插入胃管；③X線檢查胃扭轉可發現兩個胃泡影，而急性胃炎無此征象。
4.瀑布狀胃
有明顯胃動力障礙，可表現為胃底、體腔擴大并潴留大量液體。器官軸型胃扭轉應與瀑布狀胃相鑒別，鋇劑易于停滯于胃泡內形成囊狀是其相似之處。判斷胃大、小彎的位置是否顛倒，食管賁門開口部是否位于胃的下方及立位胃內是否出現兩個液平，對于兩者的鑒別診斷具有重要意義。
5.胃腸道外腫塊推壓引起的胃腸道改變
如在脾囊腫、胰尾囊腫等病變時，胃被推壓向上向內向右移位，從而使胃形改變，此時應注意胃小彎位置或食道與胃黏膜關系方可鑒別。