胞內運輸是指細胞內、細胞器間的物質交換。
有分子擴散、微絲推動原生質的環流、細胞器膜內外的物質交換，以及囊泡的形成與囊泡內含物的釋放等。如光呼吸途徑中，磷酸乙醇酸、甘氨酸、絲氨酸、甘油酸分別進出葉綠體、過氧化體、線粒體；
葉綠體中的丙糖磷酸經Pi轉運器從葉綠體轉移至細胞質，并在細胞質中合成蔗糖進入液泡貯藏；
在內質網和高爾基體內合成的成壁物質由高爾基體分泌小泡運輸至質膜，然后小泡內含物再釋放至細胞壁中等這些過程均屬胞內物質運輸。
