胰腺囊腺癌的病因尚不清楚，最近的大量研究表明，胰腺囊腺癌的發生可能與以下因素有關。
大量的研究支持胰腺囊腺癌與吸煙之間有密切聯系，吸煙引起胰腺囊腺癌的可能機制：
①吸煙促使致癌物質煙草特異性N-亞硝酸鹽分泌到膽管，隨后反流入胰管；②煙草特異性N-亞硝酸鹽對器官的特異性作用可隨血流入胰腺；③吸煙增加血脂水平，促發胰腺癌，吸煙者可能因細胞甲基化水平低而易致癌，Stolzenberg等的實驗證實，保持足夠的葉酸和吡哆醛濃度，可減少與吸煙相關的胰腺囊腺癌的危險性。
流行病學和分子流行病學的研究大多支持慢性胰腺炎可以發展為胰腺囊腺癌，Friess的研究從分子水平證明了慢性胰腺炎與胰腺囊腺癌可能存在某些聯系。
有研究顯示，服用阿司匹林的婦女，胰腺囊腺癌的發病率降低，但也有研究顯示，常規服用阿司匹林并不會降低胰腺囊腺癌的發生率，且胰腺囊腺癌發病風險可能增大。
不同種族飲酒后其胰腺囊腺癌發病率亦有不同。
實驗研究表明，胰島素在體外或體內能促使胰腺囊腺癌細胞生長。
研究顯示，胰腺囊腺癌患者中有Hp血清陽性結果，與對照組相比有顯著差異，提示Hp感染與胰腺囊腺癌有相關性。
咖啡調查發現，咖啡能使患胰腺囊腺癌的危險增加4倍，研究證明，咖啡可以抑制DNA修復并在DNA復制完成前誘導有絲分裂過程，是其致癌的主要原因。