選型
脂質體擠出器的選型主要考慮以下幾個方面：
1擠出樣品量
≤1ml：采用手推式脂質體擠出器，處理范圍為0.1~1.0ml/批次
1~15ml：采用罐體、氣動式擠出器
15~100ml：采用罐體氣動式或者連續擠出方式
>100ml：一般采用連續流方式擠出
2擠出樣品工藝
脂質體擠出過程中一個重要的參數是擠出壓力。對于一般脂質體項目而言，工藝一般有兩種：
直接擠出：對于脂質體處方要求較高，少量時可采用氣動或者手動方式擠出，大量時采用高壓連續擠出。
先均質后擠出：對于脂質體處方要求相對而言較低，但此類樣品最好先進行均質處理成較小粒徑，然后再通過擠出器擠出，否則易出現膜堵現象。
濾膜的選擇
不是所有的聚碳酸酯膜都可以用于脂質體擠出制備！只有Whatman、Millipore、Avestin等幾家為數不多的公司生產的核打孔的聚碳酸酯膜才可以。一般用于除菌的微孔濾膜膜孔分布和大小是很不均勻的，孔道是彎彎曲曲的；而核打孔的聚碳酸酯膜膜孔分布和大小是很均勻的，孔道是直的。
制成的微脂體，改變成所需粒徑大小的單層微脂體。MLV或LUV置于擠出儀中，加熱到臨界溫度以上的溫度，以氮氣或氬氣加壓，即能將粒徑較大的微脂體擠成接近濾膜孔徑大小的微脂體。重復擠壓數次后，即可制造出所需粒徑大小且粒徑分布范圍相當窄的微脂體。利用這種方法制成的微脂體可將粒徑大小控制到一百納米以下。