1.中樞神經系統感染性疾病此時腦脊應付細胞病理學變化分三個不同時期：
①急性炎性滲出期，呈粒細胞反應；②亞急性增殖期，呈激活淋巴細胞或單核-巨噬細胞反應；③修復其呈淋巴細胞反應。
2.中樞神經系統腫瘤腦脊液細胞當選可正常或稍高，以淋巴細胞為主。腦脊液中能否找到腫瘤細胞取決于腫瘤位置及惡性程度、穿刺部位和采集標本的多少。同時也與檢查者技術水平有關，采用細胞正玻片離心沉淀儀可提高檢出率。腦脊液找到白血病細胞是白血病腦膜轉移的證據。
3.腦血管病腦脊液細胞學檢查有助于鑒別腦出血或腰穿損傷性出血。前者在早期病后數小時可見大量紅細胞和明顯中性粒細胞增多，2-3天內達高峰，在腦脊液中可發現吞噬細胞，出血后數小時至第3天可出現含有紅細胞的吞噬細胞，5天后可見含鐵血黃素吞噬細胞。如為穿刺損傷性出血則不會有上述反應。
4.腦寄生蟲病不僅腦脊液細胞數升高，并可見嗜酸性粒細胞增多，約占白細胞的60%或更高。漿細胞增多為加一特點。如將腦脊液離心沉淀物全傾倒在玻片上，在顯微鏡下檢查可發現血吸蟲卵、阿米巴原蟲、弓形體、旋毛蟲的幼蟲等，甚至還可找至細粒棘球絳蟲的頭節或頭鉤。
5.紅斑狼瘡有時可在腦脊液中找到紅斑狼瘡細胞。