原理：
與血清蛋白電泳相同，利用各種蛋白質在電場作用下遷移率不同來進行檢測。由于CSF蛋白質含量較低，電泳前須進行濃縮處理。一般采用透析法濃縮，將CSF加入透析袋內，置于吸水的透析液中，CSF中的水分移至透析液內，CSF的蛋白質濃度增加后，再進行電泳分析。
腦脊液蛋白電泳試劑與器材：
（1）器材透析膜可商品化購買，亦可用玻璃紙袋；電泳設備同血清蛋白電泳醫學`教育網搜集整理。
（2）試劑透析液為聚乙二醇20000氯化鈉溶液：稱取聚乙二醇2000030.0g，氯化鈉0.9g，加90ml蒸餾水溶解，再加巴比妥緩沖液（pH8.6，0.05mol/L）10ml，混勻，溶液pH為7.4.透析液亦可用500g/L的右旋糖酐溶液。
3.方法先將CSF加入透析袋內，放入聚乙二醇20000氯化鈉溶液中，室溫透析6～7小時（如用500g/L的右旋糖酐溶液，透析2～4℃時需15小時），濃縮至0.05～0.1ml即可。濃縮的腦脊液按血清蛋白電泳的方法進行電泳分析。
正常腦脊液蛋白電泳帶與血清蛋白電泳帶有不同之處：腦脊液出現較多的前白蛋白而血清中較少；CSF的β-球蛋白略高于血清；γ-球蛋白僅為血清的一半。
