1.外生殖器檢查
除外尿道外口狹窄或其他可能影響排尿的疾病(如:包莖，陰莖腫瘤等)。
2.直腸指診（digitalrectalexamination，DRE）
直腸指診為簡單而重要的診斷方法，需要在膀胱排空后進行。應注意前列腺的界限、大小、質地。良性前列腺增生時，腺體可在長度或寬度上增大，或二者均有增大。臨床用不同方法描述前列腺增大的程度。
直腸指診估計前列腺大小有一定誤差。如中葉突向膀胱，直腸指診時前列腺腺增大則不明顯。同時，直腸指診如發現前列腺上有可疑硬結，應作穿刺活檢，以排除前列腺癌的可能。DRE異常的患者最后確診為前列腺癌的比例為26%~34%，而且其陽性率隨著年齡的增加呈上升趨勢。同時應注意肛門括約肌收縮功能，以排除神經源性膀胱功能障礙。
3.局部神經系統檢查(包括運動和感覺)
肛周和會陰外周神經系統的檢查以提示是否存在神經源性疾病導致的神經源性膀胱功能障礙。
4.尿常規
以確定下尿路癥狀（(Lowerurinarytractsymptoms,LUTS)）患者是否有血尿、蛋白尿、膿尿及尿糖等。
5.B超檢查
觀察前列腺的大小、形態及結構，有無異常回聲、突入膀胱的程度，以及殘余尿量(Postvoidresidualvolume)。常用的方法有經直腸及經腹超聲檢查。前者較準確但設備要求高，后者簡單可普及。
經直腸B超檢查時還可以測定前列腺體積，從排尿期聲像圖，判斷尿道的變形、移位，了解下尿路梗阻的動態變化，也可了解治療后狀態。經腹B超檢查在國內應用較普遍，觀察腺體內部結構不如經直腸B超檢查。
6.殘余尿測定
由于膀胱逼尿肌可通過代償的方式克服增加的尿道阻力，將膀胱內尿液排空，因此良性前列腺增生早期無殘余尿也不能排除下尿路梗阻的存在。一般認為殘余尿量達50～60ml即提示膀胱逼尿肌處于早期失代償狀態。
排尿后導尿測定殘余尿較準確。用經腹B超測定殘余尿的方法更加簡便，患者無痛苦，且可重復進行。但殘余尿量較少時則測量不夠準確。靜脈腎盂造影在膀胱充盈期及排尿后各攝片一張以觀察殘余尿的方法，因不能定量實用價值不大。同位素濃度測定，即濃度定量，可根據不同濃度溶液容量的方法測定，為最準確的方法，但成本較高，難以普及。
7.其他
磁共振成像對良性前列腺增生的診斷無特殊價值，但可協助鑒別早期前列腺癌。必要時還可進行尿流動力學檢查、泌尿系造影等。
臨床中本癥的診斷主要靠病史、直腸指診及B超檢查。膀胱鏡檢查在必要時可施行，并需進一步了解有無上尿路擴張及腎功能損害，有無神經性膀胱功能障礙、糖尿病所致的周圍神經炎及心血管疾病，最后估計全身情況及決定治療方案。