腰椎穿刺和腦脊液檢查是一項有用的輔助性實驗室檢查，但在臨床應用上并不廣泛。這是因為在大多數患者中，根據病史、臨床檢查和熒光素眼底血管造影檢查等即可明確診斷。患者的腦脊液改變主要表現為淋巴細胞增多。在炎癥發生后1周內，約80%的患者出現腦脊液淋巴細胞增多，1～3周則有97%的患者出現此種改變。腦脊液淋巴細胞增多一般于8周內消失。炎癥復發時，一般不再出現腦脊液淋巴細胞增多，因此對慢性遷延不愈的葡萄膜炎患者和復發性葡萄膜炎患者進行此項檢查已沒有診斷價值。
