苦參所含生物堿主要是苦參堿和氧化苦參堿。此外還含有羥基苦參堿、N-甲基金雀花堿、安那吉堿、巴普葉堿和去氫苦參堿(苦參烯堿)等。這些生物堿都屬于喹喏里西啶類衍生物。除N-甲基金雀花堿外，均由兩個哌啶環共用一個氮原子稠合而成。分子中均有2個氮原子，一個是叔胺氮，一個是酰胺氮。
理化性質
堿性:苦參中所含生物堿均有兩個氮原子。一個為叔胺氮(N-1)，呈堿性;另一個為酰胺氮(N-16)，幾乎不顯堿性，所以它們只相當于一元堿。苦參堿和氧化苦參堿的堿性比較強。
溶解性:苦參堿的溶解性比較特殊，不同于一般的叔胺堿，它既可溶于水，又能溶于氯仿、乙醚等親脂性溶劑。氧化苦參堿是苦參堿的氮氧化物，具半極性配位鍵，其親水性比苦參堿更強，易溶于水，難溶于乙醚，但可溶于氯仿。
極性:苦參生物堿的極性大小順序是:氧化苦參堿>羥基苦參堿>苦參堿。
提取分離
苦參以稀酸水滲漉，酸水提取液通過強酸性陽離子交換樹脂提取總生物堿。苦參堿和氧化苦參堿的分離，利用二者在乙醚中的溶解度不同進行。